現在自來水消毒大都采用氯化法，公共給水氯化的主要目的就是防止水傳播疾病。氯氣易溶于水，與水結合生成次氯酸和鹽酸，在整個消毒過程中起主要作用的是次氯酸。氯氣用于自來水消毒具有消毒效果好，費用較低的優點，但是有一定的弊端，氯化消毒后的自來水能產生致癌物質。目前世界上安全的自來水消毒方法是臭氧消毒，不過這種方法的處理費用昂貴，而且經過臭氧處理過的水，保留時間是有限，所以目前只有少數的發達地區才使用這種處理方法。